2011年9月20日に復元され、中は当時の貿易に関する史料や貿易品などが展示。平戸オランダ商館のある崎方町一帯は、1609年（慶長14）和蘭船が入港し、1641年（寛永18）長崎出島に移転するまでの約33年間、平戸が我が国唯一のオランダ貿易港として賑わった。商館は当初、土蔵付き民家を借りてスタートしたが、その後周囲の民家を壊して、新たに建築。本館をはじめ、宿泊所、調理場などが整備されていった。貿易の積荷を保管する倉庫も何棟も建築され、1639年には日本で初めての西洋の石造建造物とされる「1639年築造倉庫」が完成。2011年にオープンした「平戸オランダ商館」はこの倉庫の忠実な復元となり、貴重な建物である。1641年、幕府の命により商館は取り壊され貿易は長崎出島に移転した。

※一般の駐車場はありませんので、平戸港交流広場駐車場をご利用下さい。(身障者専用駐車場有)